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      9. 微量轉錄組測序技術獲新突破

        發布于 2012/09/06閱讀(1642)來源 ljy標簽 微量轉錄

        摘要

        9月4日電 今天,華大基因科技公司在國內率先推出微量真核轉錄組測序技術服務—TruSeq微量轉錄組

        內容

            9月4日電 今天,華大基因科技公司在國內率先推出微量真核轉錄組測序技術服務—TruSeq微量轉錄組。該技術在國內首次通過TruSeq RNA試劑盒成功實現轉錄組的微量建庫,總RNA建庫起始量低至200ng,突破了微量或珍貴樣品進行常規轉錄組建庫風險高、成功率低的瓶頸,實現了高效、穩定的微量轉錄組測序。

          轉錄組即特定組織或細胞在某一功能狀態下所有基因轉錄產物的總和,是連接基因組遺傳信息與蛋白質組生物功能的紐帶。轉錄組研究是基因功能及結構研究的基礎和出發點,目前已經被廣泛應用于基礎生物學、醫學、農學等領域。然而,常規轉錄組建庫對樣品量的要求較高,許多達不到最低樣品量要求的樣品無法進行常規建庫,比如來源稀少的干細胞、腫瘤等臨床樣本,彌足珍貴的考古樣本以及一些RNA提取困難、容易降解的特殊樣品。對于這些樣品量不足的樣品即使能夠建庫成功,也會對測序的質量有所影響,且同一個體在不同生長時期及生長環境下基因表達情況有所差異,混合樣品建庫又會影響分析結果。這使得RNA樣品量不足成為制約轉錄組研究的重要瓶頸之一。

          使用TruSeq微量轉錄組,研究人員只需從樣品中提取出200ng的總RNA,便可進行建庫、測序及后續信息分析。該技術不僅在建庫起始量上取得突破,也極大地提高了測序數據的質量。同時,該技術還采用磁珠純化的方式,大幅度縮短了建庫時間,提高了實驗效率。TruSeq RNA微量轉錄組的使用,可方便科研人員有效獲取某一物種特定微量或珍稀樣本在某一狀態下幾乎所有轉錄本序列信息,為后續的基因功能等研究奠定基礎。

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